Version 1.4.0






Bienvenue sur notre interface de calcul de l’indice multimétrique BECOME (Bioindication des ECOsystèmes Mares et Étangs) et de son outil diagnostique. Vous trouverez également sur cette page des documents utiles pour la bonne application du protocole permettant de calculer l’indice. L’utilisation de cette interface est libre et gratuite et ne requiert aucune identification.

Une formation aux protocoles d’échantillonnage et à l’identification des macroinvertébrés et macrophytes des mares et étangs est fortement recommandée avant utilisation de l’indicateur.

BECOME permet d’évaluer l’état écologique et de conservation de tous les plans d’eau peu profonds permanents ou semi-permanents de moins de 50 ha de France continentale, à partir de l’étude des macroinvertébrés et des macrophytes.

C’est le seul indicateur français pour les mares et étangs dont:

  • les protocoles et indicateurs ont fait l’objet d’une validation scientifique indépendante dans des revues scientifiques internationales,

  • l’évaluation repose sur des sites de références identifiés à partir de critères objectifs et rigoureux (sites dépourvus de pression)

  • les facteurs environnementaux qui influencent les communautés (altitude, ombrage, superficie, climat, géologie...) sont pris en compte avec précision, chaque plan d’eau est considéré dans son unicité, grâce à des modèles prédictifs.

  • la sensibilité aux pressions d’origine anthropique (mais aussi biotiques internes) a été démontrée.

L’indice est ainsi sensible:

  • à l’occupation du sol (culture, urbanisation et prairies fertilisées ou surpâturées) ;

  • aux apports de polluants dans le plan d’eau (en provenance de l’amont, chaulage, fertilisation, agrainage...) ;

  • au bétail accédant au plan d’eau et aux apports de fumier ;

  • aux espèces exotiques envahissantes (écrevisses, poissons, rongeurs) ;

  • aux altérations morphologiques (berges verticales ou artificialisées, sommet de berge piétiné ou surentretenu) ;

  • à la présence de cyprinidae ;

  • aux altérations associées aux surpopulations d’oiseaux d’eau (guanotrophication, destruction de la végétation) ;

  • aux assecs et à la gestion hydraulique ;

  • à l’empoissonnement des plans d’eau naturellement apiscicoles.

Son outil diagnostique permet d’identifier les pressions à l’origine des altérations, et quantifie leur intensité probable. Il peut être utilisé pour évaluer les actions menées sur les pressions ciblées.



Résultat de l’outil diagnostique avant et après restauration (désempoissonnement et mise en défens contre le bétail) d’un plan d’eau de montagne dans les Pyrénées. Lorsque la pression dépasse la ligne rouge pointillée, la probabilité qu’elle ait impacté les communautés est d’environ 100%. Si la pression est inférieure à la ligne orange pointillée, cette probabilité est d’environ 0%. Entre les deux lignes, elle est d’environ 50%. Plus la valeur est proche de 1, plus l’intensité de l’impact est probablement élevée. L’outil diagnostique démontre l’efficacité des mesures de restauration : les communautés ne sont plus significativement altérées par l’empoissonnement et le bétail accédant au plan d’eau, et moins défavorisées par des berges rocheuses et verticales naturellement défavorables. Suite à cette restauration, le plan d’eau est passé d’un état moyen à un bon état écologique d’après l’indice BECOME.

BECOME a été financé principalement par Aquabio, société coopérative en environnement, membre de l’économie sociale et solidaire, avec une participation de l’ADEME et de la FDAAPPMA de Gironde dans le cadre d’une initiative PME biodiversité (projet BIOME). Ces travaux ont eu pour objet de :

  • développer des protocoles d’échantillonnage adaptés à une évaluation robuste des mares et étangs,

  • identifier quels facteurs environnementaux influençaient les communautés (et les potentielles métriques de l’indice),

  • développer des indicateurs pour évaluer les mares et étangs et identifier les pressions à l’origine de leurs altérations.

Les co-auteurs des protocoles et indicateurs BECOME :

  • Frédéric Labat, docteur en écologie aquatique. Hydrobiologiste à Aquabio depuis 2002, il a enseigné l’écologie aquatique et l’hydromorphologie à l’ENSEGID pendant six ans. Spécialiste des invertébrés aquatiques et macrophytiste. Naturaliste amateur, il passe une partie de son temps libre à identifier invertébrés aquatiques et imagos de Diptères. Ses sujets de recherche sont la bioindication et le fonctionnement des mares et étangs, et plus largement l’impact des pressions anthropiques sur les communautés aquatiques.

  • Christophe Piscart, Directeur de recherche au CNRS, ECOBIO et spécialiste des invertébrés (en particulier expert des amphipodes d’eau douce). Il étudie principalement l’impact des changements globaux (occupation du sol, changement climatique, salinisation…) sur les écosystèmes aquatiques.

  • Gabrielle Thiébaut, Professeure à l’Université de Rennes 1, ECOBIO. Après avoir étudié l’impact des pressions anthropiques sur les macrophytes des cours d’eau, elle étudie les macrophytes proliférants et leur impact sur les écosystèmes aquatiques.

  • Philippe Usseglio-Polatera, Professeur à l’Université de Metz, LIEC. Ses travaux de recherche portent principalement sur l’étude de l’impact des pressions anthropiques sur les communautés aquatiques, et le développement d’indicateurs biologiques et d’outils diagnostiques pour évaluer ces écosystèmes.

  • Et toute l’équipe d’Aquabio!

Aquabio propose de nombreux indicateurs complémentaires, des outils d’aide à l’interprétation, des formations et diverses formules d’accompagnement. Pour plus d’information sur nos prestations relatives aux plans d’eau peu profond, contact : plan.deau@aquabio-conseil.com

Mises à jour depuis Labat & Usseglio-Polatera, 2023 :

  • 11/11/2023 Consolidation de l’outil diagnostique basée sur des données récoltées dans 347 plans d’eau (vs 318 dans Labat et Usseglio-Polatera, 2023)

  • 27/02/2024 Le calcul de l’indice est désormais possible à l’échelle de l’Europe. L’interface fournit la liste faunistique standardisée et pondérée pour faciliter le travail des scientifiques européens qui souhaitent calculer ou développer de nouveaux indices à partir de données récoltées avec le protocole S3i. Soyez très prudent pour interpréter les résultats si les sites d’étude se situent sur des iles (les effets de l’insularité ne sont pas pris en compte dans les modèles) ou dans des régions très éloignées de la France ou aux conditions climatiques très différentes de celles que l’on peut observer en France entre 0 et 3000m d’altitude et qui ont servi à caler les modèles (en particulier une partie de la zone méditerranéenne et la Scandinavie)

  • 12/09/2024 Consolidation de l’outil diagnostique basée sur des données récoltées dans 388 plans d’eau. L’objectif principal de cette MAJ était de mieux intégrer l’influence des pratiques propres aux étangs piscicoles : agrainage, apports d’azote, de phosphore ou de fumier, chaulage, ou encore gestion hydraulique. Et d’augmenter encore la fiabilité des modèles afin d’obtenir une hiérarchisation des pressions la plus fiable possible pour chaque mare ou étang.

  • 23/11/2024 Nouvelle version de l’indice et de l’outil diagnostique : consolidation et meilleure prise en compte des usages propres aux étangs piscicoles et de l’impact de l’empoissonnement dans les plans d’eau naturellement apiscicoles, modification des outils pour une utilisation plus simple.




Pour appliquer le protocole et calculer l’indice :

  • Le guide du débutant, qui retrace les informations essentielles pour la bonne application du protocole (MAJ 09/04/2024) - Cliquez ici  

  • Le guide d’application de la méthode, de l’échantillonnage au traitement laboratoire des échantillons - Cliquez ici  

  • Le guide d'interprétation de l'indice et des outils associés (MAJ 23/11/2024) - Cliquez ici  

  • Le fichier de saisie et d'échange pour calculer l’indice - Cliquez ici  

Pour plus d’informations sur l’outil BECOME et les autres indicateurs :

Les publications scientifiques internationales qui ont conduit à l’indicateur BECOME (accessibles à la demande sur Researchgate) :


Nos protocoles permettent aussi de répondre à d’autres problématiques:


Afin de faciliter les identifications des invertébrés caractéristiques des mares et étangs, nous mettons progressivement à disposition des clés d’identification:



Format accepté: .xlsx - 5 Mo Max.